第一节 沿革
1949年5月上海解放，中国人民解放军上海市军事管制委员会任命赵虞为接管专员，接管普陀区区公所。6月3日，成立区接管委员会，赵虞任主任委员，驻军团长范国璋、公安分局局长董镇任委员。经过一年政务接管和民主建政工作，1950年6月，成立普陀区人民政府，由市人民政府直接领导。区接管委员会随之撤销。
1955年7月，区第一届人民代表大会第二次会议选举产生首届区人民委员会（简称区人委），至1965年12月，先后举行过五届人民代表大会会议，选举过五届正、副区长和人民委员会委员。区人民委员会，即区人民政府，既是区人民代表大会的执行机关，又是区的行政机关。
“文化大革命”开始后，1967年1月，区人委及其工作部门先后被造反派夺权，停止工作。1968年2月29日，成立区革命委员会，实行党、政合一的体制，包揽党、政、司法等各项工作。1970年6月中共区委恢复后，区革命委员会为行政机关。
1976年10月，粉碎江青反革命集团后，区革命委员会工作延续了一段时间。1980年8月，区第七届人民代表大会第一次会议，依法恢复区人民政府的名称，选举产生区长、副区长，组成第七届区人民政府。到1993年，共产生过11届区人民政府。
1984年真如镇划入普陀区后，先后举行过第十、十一、十二、十三届镇人民代表大会会议，组成第十、十一、十二、十三届镇人民政府。
区长、副区长（主任、副主任）更迭表
第二节工作机构
1949年6月，区接管委员会设秘书室和民政、户政、文教、调解4股，同时建立普陀公安分局。
1950年6月，区人民政府设置秘书室和民政（包括调解工作）、工商、文教、卫生4个科（户政股于1950年3月移交公安分局、调解工作于1952年并入区法院）， 8月，建立上海市税务局普陀区分局。1952年第二季度，建立劳动科、人事科，秘书室改为办公室。
1954年，增设财政科、统计科和手工业科。1955年7月，建立粮食科。1956年，原工商科分设为工业科和商业科；原文教科分设为文化科和教育科。增设民族宗教华侨事务科、建设科和体育运动委员会。
1956年末，区人委设办公室、人事科、民政科、劳动科、财政科、统计科、教育科、卫生科、文化科、工业科、商业科、手工业科，民族宗教华侨事务科、建设科、体育运动委员会、公安分局、税务分局。
1957年9月，撤销统计科，统计工作划归办公室；撤销工业科、手工业科，建立工商行政管理科。商业科又分出服务科。增设房地产管理科。12月，教育科改为教育局。1958年2月，卫生科改为卫生局。12月，粮食科、商业科、服务科合并，成立商业局。1959年3月，财政科与税务分局合并，建立财政局。6月，建设科改为建设局，撤销工商行政管理科，恢复工业科。10月，增设交通运输局。1961年1月，劳动科改为劳动局。商业局分为一局、二局。
1962年5月，撤销建设局，恢复建设科。7月，撤销房地产管理科，建立房地产管理局，商业一局、二局又合并为商业局。9月，撤销工业科，恢复工商行政管理科，财政局预算管理科划归区人委，重新建立财政科，财政局恢复为税务分局。10月，从商业局中分出粮食局，并建立上海市供销合作社普陀区办事处。1963年，原区委城市人民公社领导小组办公室改为地区工作办公室，由区人委领导。5月，建立手工业管理局。10月，商业局和市供销合作社普陀区办事处合并，建立财贸办公室。1964年10月，撤销交通运输局，改为交通科。
1965年末，区人委设办公室、地区工作办公室、人事科、民政科、财政科、文化科、建设科、交通科、工商行政管理科、民族宗教华侨事务科、教育局、卫生局、劳动局、粮食局、房地产管理局、手工业管理局、财贸办公室、体育运动委员会、公安分局、税务分局。
1968年2月，区革命委员会成立，设办公室，取代区委办公室和区人委办公室；政工组包揽区委组织、宣传、监察和区人委人事工作部门；生产组负责工交、财贸、劳动等方面的工作；教卫组负责教育、卫生等工作。
1969~1971年间，撤销政工组，另设组织组、政宣组、专案组；撤销生产组，另设工交组、财贸组、地区组；成立上山下乡办公室和“五七”干校；房地产管理局、手二业管理局、粮食局、税务分局等相继成立了局革命委员会。1973年3月，恢复体育运动委员会。1974年8月，建立人民防空办公室。1975年2月，撤销教卫组，另设教育组、卫生组和工宣队办公室。
粉碎江青反革命集团后，1977年10月，恢复民政科。1978年2月，建立集体事业管理局。4月，恢复劳动局。5月，恢复工商行政管理科。7月，恢复教育局、卫生局和文化科。1979年1月，恢复财贸办公室，建立城市建设办公室、住宅建设办公室，民政科和工商行政管理科分别改为民政局和工商行政管理局。4月恢复民族宗教事务科。5月，恢复人事科。9月，建立外事办公室和华侨事务办公室。
1981年7月，建立司法科。1982年1月，撤销外事办公室，外事工作划归区政府办公室。8月，建立科学技术委员会。1983年5月建立生产合作联社（1987年改为街道经济管理办公室），1984年6月至9月，建立审计局、物价局和环境保护办公室，人事科、司法科、文化科分别改为局的建制。1985年12月，民族宗教事务科改为民族宗教事务局。1986年5月，建立档案局。6月，建立计划经济委员会。12月住宅建设办公室改为事业单位。1987年10月，建立台湾事务办公室。12月，建立监察局。1988年8月，建立商业委员会（筹），房地产管理局分为房产管理局和土地局。1989年5月，恢复外事办公室。7月，建立法制办公室。1990年6月，城建系统机构调整，建立建设委员会、市政管理委员会，设规划土地管理局、环境保护局、房产管理局、环境卫生管理局、建设管理局。1990年10月，建立计划生育委员会。
1990年末，区人民政府设办公室（法制办公室合署）、人事局（编委办合署）、民政局、司法局、监察局、档案局、物价局、审计局、劳动局、民族宗教事务局、文化局、教育局、卫生局、计划生育委员会、体育运动委员会、侨务办公室、外事办公室、台湾事务办公室、集体事业管理局、工商行政管理局、粮食局、财贸办公室（商业委员会（筹）合署）、计划经济委员会、科学技术委员会、建设委员会、市政管理委员会、规划土地管理局、房产管理局、环境保护局、环境卫生管理局、建设管理局、人民防空办公室、公安分局、税务分局。尚有街道经济管理办公室（未列为政府工作机构序列）。
区人民政府除常设工作部门外，还设置一些协调性的工作机构。主要有：人民防空委员会、防火安全委员会、青少年保护委员会、妇女儿童保护委员会、爱国卫生运动委员会、职工教育委员会、成人教育委员会、退休职工管理委员会、老龄委员会、高等教育招生委员会、中等学校招生委员会、群众文化工作委员会、抗震救灾委员会、植树绿化委员会、地方志编纂委员会、地名委员会、军事设施保护委员会、住房制度改革领导小组、无线电管理领导小组、电力设施保护网领导小组、人口普查领导小组、清查整顿社会团体领导小组、防汛指挥部、幼托办公室等。
第三节 派出机构
1949年6月，区接管委员会在药水弄建立第一个接管专员办事处，为区接管委员会的地区派出机构。8月，建立第二办事处，1950年2~3月，相继建立第三、四办事处。办事处建立后，废除保甲制度，筹建新的居民组织。1950年6月，区人民政府成立，接管专员办事处撤销，设立区人民政府派出人员办事处。具体联系与指导街道里弄居民工作。7月，真如区朱家湾镇及新径区吴淞江以北地区划归普陀区，分别设立第五、六、七办事处。1953年4月，以两个公安派出所所辖区设一个办事处，全区划分为8个办事处。5月，派出人员办事处改为区人民政府办事处。
1955年1月，根据第一届全国人民代表大会第四次会议通过的《城市街道办事处组织条例》，区人民政府办事处定名为街道办事处，作为政府的派出机关，直属区政府领导。6月，8个街道办事处调整为22个，后增加到26个。1957年11月，重新调整为14个。1959年，又合并为8个街道办事处。1960年4月，根据中共中央指示精神，在市委统一部署下，以街道办事处为单位筹建城市人民公社，同时成立党委，实行“一元化”的领导体制。后根据中共中央指示，城市人民公社未建立。1963年调整为9个街道办事处。
“文化大革命”开始后，各街道办事处先后被造反派夺权，1967年下半年起，各街道造反组织自行筹备成立“街道革命委员会”。1968年2月，区革命委员会成立后，对“街道革命委员会”进行了整顿，1968年8月，朱家湾街道革命委员会成立。1969年3~4月，其余8个街道也相继成立革命委员会。
1976年10月，粉碎江青反革命集团后，恢复街道办事处。由于居民人口增加和区域面积扩大，1981年8月，调整为11个街道办事处。1987年10月，又新建2个街道办事处。1990年，全区有普陀路、胶州路、沙洪浜、长风新村、曹杨新村、曹安路、东新村、朱家湾、中山北路、宜川新村、甘泉新村、石泉新村、沪太新村共13个街道办事处。